Пытаясь как и Вы запустить mysqltuner вываливается ошибка
# ./mysqltuner.pl ./mysqltuner.pl: строка 6: ошибка синтаксиса около неожиданной лексемы `newline' ./mysqltuner.pl: строка 6: `<!DOCTYPE html>'
Или:
# perl mysqltuner.pl
Bareword found where operator expected at mysqltuner.pl line 13, near "<title>MySQLTuner"
(Missing operator before MySQLTuner?)
syntax error at mysqltuner.pl line 9, near "<"
Unrecognized character \xC2; marked by <-- HERE after at master <-- HERE near column 52 at mysqltuner.pl line 13.
Так вот ошибка это появляется из-за того что скрипт был скачен через утилиту wget и скачать удалось только html страницу.
Предлагаю скачивать по этой ссылке:
#wget https://raw.githubusercontent.com/major/MySQLTuner-perl/master/mysqltuner.pl